工藤新一是全国著名的高中生侦探，在一次追查黑衣人犯罪团伙时不幸被团伙成员发现，击晕后喂了神奇的药水()，工藤新一变回了小孩！新()一找到了经常帮助他的阿()笠博士，博士为他()度身打造不少间谍武器。为了防()止犯罪团伙对他进行报()复，新()一决定()隐姓()埋名，暗中追查他们，希望能得到解药。一日，新一 的女()友毛利兰来到了阿笠博士的家寻找男友的下落，被小兰撞()见的新一情急之下编造了自己名叫江户川柯南，随后柯南寄居在了小兰家。小兰的父亲毛利小五郎是一名私家侦探，新一可以籍着和他一起四出办案一起追查黑夜人的下落。柯南在小学认识步美等小学生，他()们一起组织了一个少年侦探团()，向罪犯宣战！